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斐迪南二世才可专注于向南方穆拉比特王朝残余势力地区进攻，征服了阿尔坎塔拉及阿尔布开克。1163年斐迪南二世又打败了阿方索一世取得萨拉曼卡。

1170年，斐迪南二世成立了圣地亚哥骑士团，以保护朝圣者前往使徒詹斯在波斯特拉大教堂的墓地。

1175年，教皇亚历山大三世以血亲婚姻为由废除费迪南二世和葡萄牙公主乌拉卡的婚姻。国王再次与拉腊伯爵努诺·德·劳拉的女儿特雷莎·努涅斯·德·劳拉结婚。在1178年与卡斯蒂利亚爆发了战争。斐迪南二世突袭他的侄子卡斯蒂利亚国王阿方索八世，占领了卡斯特罗赫里斯和杜埃尼亚斯。这场战争在1180年因双方签订托德西利亚斯和议而解决。同年，斐迪南二世的妻子特雷莎再分娩第二个儿子时去世。

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翻译后修饰（英语：Post-translational modification，缩写PTM；又称后转译修饰）是指蛋白质在翻译后的化学修饰。对于大部份的蛋白质来说，这是蛋白质生物合成的较后步骤。PTM是细胞信号传导中的重要组成部分。

蛋白质，或是多肽，是多条或一条胺基酸的链。当合成蛋白质时，20种不同的胺基酸会合并成为蛋白质。胺基酸的转译后修饰会附在蛋白质其他的生物化学官能团（如醋酸盐、磷酸盐、不同的脂类及碳水化合物）、改变胺基酸的化学性质，或是造成结构的改变（如建立双硫键），来扩阔蛋白质的功能。

再者，酶可以从蛋白质的N末端移除胺基酸，或从中间将肽链剪开。举例来说，胰岛素是肽的激素，它会在建立双硫键后被剪开两次，并在链的中间移走多肽前体，而形成的蛋白质包含了两条以双硫键连接的多肽链。

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